A Igreja do Senhor Jesus, necessita de braços eficientes para o serviço, dos quais podemos denominar ministérios, que se dividem em sua maioria em Departamentos, sendo bem mais funcionais e abrindo um leque de ação maior na igreja, capacitando e utilizando maior número de leigos e seus dons.

Cada Ministério é estruturado de acordo com suas necessidades, diretrizes e respectivas funções. Tem suas bases de trabalho exposto pela visão de nossa Igreja, estando, a rigor, as lideranças dos Ministérios, Departamentos e Superintendências, em sintonia de trabalho e dentro da visão ministerial dado pelo Pastor Sênior, Pr. Eduardo Itaborahy. Os Ministérios se interagem mutuamente, funcionando em conjunto com os departamentos e atividades gerais da Igreja.